Der Wurzelstumpf kann nach der Fällung entweder im Boden verbleiben oder entfernt werden. Die Entfernung erfolgt durch Ausgraben oder den Einsatz einer Stubbenfräse. Das Fräsen ist weniger invasiv und hinterlässt einen feinkörnigen Mulch, der als Bodendecker genutzt werden kann. Die Entscheidung hängt von der späteren Nutzung der Fläche ab.